Имеет ли смысл использовать DNSCrypt?

Даже если нет спуфинга от вашего ISP, то локальный DNS кэш уменьшит задержку перед отображением сайта (у меня, например, по статистике 60-70% запросов разрешаются из кэша). Ещё можно настроить политики фильтрации.