С чем связано такое падение скорости?

Хочешь стабильной ветки, качай форк некорея GitHub - Mahdi-zarei/nekoray: Qt based cross-platform GUI proxy configuration manager (backend: sing-box) , он обновляется не раз в год

Спасибо, опробую.

У меня ни один сайт с ECH как не открывался, так и не открывается без Zapret / VPN (примерно с 5 ноября).

Только на платных тарифах, на бесплатном приходится немного изощряться с помощью специальных комманд

Это не так. Яндекс не цензурирует ответы DNS.

Возможно, ваш провайдер перехватывает нешифрованные DNS-запросы, в таком случае вы тестировали фактически DNS-сервер провайдера, который вам и ответил вместо Яндекса.

Собственно именно поэтому классический plain-text DNS в наше время использовать не стоит - протокол создавался во времена, когда джентльменам верили на слово, а костыли типа DNSSEC не прижились, да и смысла в них уже нет, проще шифровать.